В начале сентября в НИУ ВШЭ состоялось первое мероприятие консорциума «Генетика сердечно-сосудистых заболеваний» — междисциплинарный форум «Кардиогенетика и биоинформатика: реалии 2021», который ознаменовал начало работы консорциума после подписания соглашения о научном сотрудничестве между организациями, входящими в состав консорциума. В форуме приняли участие руководители и представители научных центров и институтов Москвы, Санкт-Петербурга, Новосибирска, Архангельска, Тюмени и Сургута.
Международная лаборатория биоинформатики приняла участие и выступила соорганизатором Московской конференции по вычислительной молекулярной биологии (Moscow Conference on Computational Molecular Biology) 30 июля – 02 августа 2021 в Сколтех
10-я Московская международная конференция по компьютерной молекулярной биологии (MCCMB 21) состоялась 30 июля – 2 августа 2021 года в Сколтех, г. Москва, Россия. Международная лаборатория биоинформатики выступила соорганизатором MCCMB. Сотрудники лаборатории выступили с докладами, участвовали в дискуссия и представили тезисы к публикации в ежегодный сборник конференции.
19 мая 2021 года на факультете компьютерных наук прошла онлайн-конференция ABZ2021. В ней приняли участие более 200 ученых из 24 стран, в том числе генетики, молекулярные биологи, химики, биохимики, иммунологи, специалисты по структурной и клеточной биологии, а также специалисты в области машинного обучения. Организатор – факультет компьютерных наук, соорганизаторы – Molecules (an open access journal by MDPI), RNA Society, International Journal of Molecular Sciences и InsideOutBio.
Конференция была посвящена Z-ДНК и Z-РНК – высокоэнергетическим левозакрученным конформационным вариантам B-ДНК и A-РНК, которые выполняют молекулярные биологические функции, чье нарушение приводит к заболеваниям.
Флипоны – это альтернативные структуры ДНК, которые формируются под внешним воздействием и регулируют включение и выключение генов, а также работу внутреннего клеточного иммунитета – например, интерферонный ответ и запуск некроптоза в ответ на вирусные инфекции. Также флипоны вызывают генетическую нестабильность, в результате чего могут возникать различные заболевания, из которых рак – наиболее изученное.
Биологическая роль альтернативных структур нуклеиновых кислот всегда считалась противоречивой, особенно в случае Z-ДНК. Потребовались новые методы анализа, позволившие обнаружить белки, специфически связывающиеся с левозакрученными формами ДНК и РНК, и новые генетические исследования, показывающие воздействие вариантов данных белков на фенотип. Были определены условия, вызывающие «переключение» правозакрученной спирали в левозакрученную.
Во время конференции свои исследования представили 18 ученых. Большая часть представленных результатов ранее не публиковались.
Цель консорциума – создать базу мутаций населения Российской Федерации при сердечно-сосудистых заболеваниях.
В рамках консорциума организовано сотрудничество с кардиологическими медицинскими учреждениями, которые могут предоставить биоматериал и клиническую информацию о пациентах, и учреждениями, которые могут осуществить полногеномное секвенирование. Биоинформатическую обработку больших данных секвенирования, а также создание базы данных мутаций берет на себя факультет компьютерных наук НИУ ВШЭ.
В будущем состав консорциума будет только увеличиваться, сегодня идет обсуждение о вступлении двух научно-исследовательских организаций.
Научно-учебная лаборатория биоинформатики факультета компьютерных наук совместно с ГБОУ ДПО Российской медицинской академии непрерывного профессионального образования Минздрава РФ стала организатором круглого стола «Пилотные проекты для исследования генетики сердечно-сосудистых заболеваний».
.png "Первая Школа \"Кардиогенетика и биоинформатика – Гипертрофическая кардиомиопатия\" 29 июня 2021")
